Doel Materiaal en methode
- je beschrijft wat er is gedaan
- en hoe het is gedaan
- dit doe je per experiment
Opbouw M&M
| Onderdeel | Niet alle onderdelen hoeven gebruikt te worden |
|---|---|
| 1 | a. Geef een algemene introductie en overzicht van de materialen/methode. b. Herhaal het doel van het werk. c. Geef aan waar het gebruikte materiaal vandaan komt. d. Geef essentiële achtergrond informatie. |
| 2 | a. Geef specifieke en precieze details over materialen en methode (bv hoeveelheden, temperatuur, duur, volgorde, condities, locaties, grootte) b. Verklaar de gemaakte keuzes. |
| 3 | a. Relateer de materialen en methode aan andere studies |
| 4 |
Tutor taken/M&M Kopjes
- Stamboom analyse
- Doel: over ervingspatroon vaststellen
- Materiaal: stamboom
- van X aantal generaties met Y aantal mensen
- hou het op 2 a 3 zinnen in dat paragraaf
- Diagnose stellen met omim
- Doel: diagnose stellen
- Materiaal:
- Gebruikte zoektermen/strategie/filters
- OMIM(vol uit 1 keer)(ref)
- Mutatie analyse
- Doel: vaststellen of het kandidaat gen een pathogene mutatie bevat
- Materiaal:
- Gen-naam(accesiecode)(ref)
- NCBI(refseq),
- Primerontwerper (primerblast)(ref)
- parameters
- primersequentie
- PCR om te vermeerderen
- (ref → lab protocol)
- Gelektroforese
- (ref → lab protocol)
- Sanger sequencing
- (dit heb je niet gedaan, maar doe maar alsof)
- (ref naar een artikel waar ze sanger sequencing doen)
- (sanger sequencing zoals → neveling kort & nevling full)
- vergelijken met refseq
- dbSNP(ref)
- ClinVar(ref)
- Targeted exome sequencing
- Doel: pathogene vaiant vinden in 111 RP genen
- Materiaal:
- Whole exome sequencing
- Doel: het vinden van de pathogene variant in alle exonen
- Materiaal:
Regels
Induividueel eerste blok alleen voldoende/niet voldoende handin.han.nl mag in het engels en nederlands
Context/Doel:
2 a 3 zinnen lang
Context: eerste zin iets met DNA/mRNA/Ewit sequenties Doel: “Het doel van het onderzoek is…”
Materiaal(Data)
- Organismen
- Format (fasta)
- NCBI
Methode en resultaten
Methode
- Programeertaken
- algoritmes
- modules
- Needle MAFFET
Resultaten
- alleen de belangrijkste punten
- per week taak
- accuraat, objectief en duidelijk
- dus niet het is aan de hoge kant
- maar het is het hoogst op
Discussie
- implicatie
- wat betekenen de resultaten?
- applicatie
- wat kunnen anderen nou met dit onderzoek?
- Beperking
- Voorbeeld
- je hebt maar 5 organismen
- je hebt maar 1 gen onderzocht
- Voorbeeld
Samenvatting
- Max 400 woorden
- geen bronverwijzing
Verboden woorden
- alles det er op duidt dat we een opleiding doen en geen onderzoeker zijn
- tutor
- Han
- tutorgroep
- student
- weektaak
- school
- studie
- Soort van verboden worden
- Ons
- Wij
- Ik
- alles is altijd in voltooide of verleden tijd