noortje

Doel Materiaal en methode

  • je beschrijft wat er is gedaan
  • en hoe het is gedaan
  • dit doe je per experiment

Opbouw M&M

OnderdeelNiet alle onderdelen hoeven gebruikt te worden
1a. Geef een algemene introductie en overzicht van de materialen/methode.

b. Herhaal het doel van het werk.

c. Geef aan waar het gebruikte materiaal vandaan komt.

d. Geef essentiële achtergrond informatie.
2a. Geef specifieke en precieze details over materialen en methode (bv hoeveelheden, temperatuur, duur, volgorde, condities, locaties, grootte)

b. Verklaar de gemaakte keuzes.

c. Geef aan dat de juiste voorzorgsmaatregelen genomen zijn.
3a. Relateer de materialen en methode aan andere studies
4a. Geef aan waar problemen optraden

Tutor taken/M&M Kopjes

  1. Stamboom analyse
    1. Doel: over ervingspatroon vaststellen
    2. Materiaal: stamboom
      1. van X aantal generaties met Y aantal mensen
    3. hou het op 2 a 3 zinnen in dat paragraaf
  2. Diagnose stellen met omim
    1. Doel: diagnose stellen
    2. Materiaal:
      • Gebruikte zoektermen/strategie/filters
      • OMIM(vol uit 1 keer)(ref)
  3. Mutatie analyse
    1. Doel: vaststellen of het kandidaat gen een pathogene mutatie bevat
    2. Materiaal:
      • Gen-naam(accesiecode)(ref)
      • NCBI(refseq),
      • Primerontwerper (primerblast)(ref)
        • parameters
        • primersequentie
      • PCR om te vermeerderen
        • (ref lab protocol)
        • Gelektroforese
          • (ref lab protocol)
      • Sanger sequencing
        • (dit heb je niet gedaan, maar doe maar alsof)
        • (ref naar een artikel waar ze sanger sequencing doen)
      • vergelijken met refseq
        • dbSNP(ref)
        • ClinVar(ref)
  4. Targeted exome sequencing
    1. Doel: pathogene vaiant vinden in 111 RP genen
    2. Materiaal:
  5. Whole exome sequencing
    1. Doel: het vinden van de pathogene variant in alle exonen
    2. Materiaal:

Regels

Induividueel eerste blok alleen voldoende/niet voldoende handin.han.nl mag in het engels en nederlands

Context/Doel:

2 a 3 zinnen lang

Context: eerste zin iets met DNA/mRNA/Ewit sequenties Doel: “Het doel van het onderzoek is…”

Materiaal(Data)

  • Organismen
  • Format (fasta)
  • NCBI

Methode en resultaten

Methode

  • Programeertaken
  • algoritmes
  • modules
  • Needle MAFFET

Resultaten

  • alleen de belangrijkste punten
    • per week taak
  • accuraat, objectief en duidelijk
    • dus niet het is aan de hoge kant
    • maar het is het hoogst op

Discussie

  • implicatie
    • wat betekenen de resultaten?
  • applicatie
    • wat kunnen anderen nou met dit onderzoek?
  • Beperking
    • Voorbeeld
      • je hebt maar 5 organismen
      • je hebt maar 1 gen onderzocht

Samenvatting

  • Max 400 woorden
  • geen bronverwijzing

Verboden woorden

  • alles det er op duidt dat we een opleiding doen en geen onderzoeker zijn
    • tutor
    • Han
    • tutorgroep
    • student
    • weektaak
    • school
    • studie
  • Soort van verboden worden
    • Ons
    • Wij
    • Ik
  • alles is altijd in voltooide of verleden tijd